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Fue adoptada el 17 de Mayo de 1912 por el Poder Legislativo, siendo la iniciativa del entonces Presidente de la República Dr. Manuel Enrique Araujo. Durante el breve gobierno de este se realizó una revista militar y concentración de ciudadanos para conmemorar el día de la Independencia Centroamericana y la juramentación del nuevo pabellón y Escudo Nacional.

Izada por el propio doctor Araujo frente a la tribuna Presidencial del Campo Marte en la mañana de el 15 de Septiembre de 1912, haciendola así el Símbolo Oficial de la República.

La nueva Bandera que otrora fuera símbolo de la Federación Centroamericana, con los colores azul y blanco y las palabras: "Dios Unión Libertad", fue hecha bajo las órdenes del General Manuel José Arce. Esta había sido adoptada por decreto legislativo del 17 de Mayo, impreso en el Diario Oficial del día 30 del mismo mes y año.

De acuerdo con el Capitulo I, Art. 3 y 4 de la "Ley de Símbolos Patrios" (Decreto N. 115, con fecha del 14 de Sept. de 1972) se dice que, la descripción de la Bandera Nacional es la siguiente:

Consiste de un paralelogramo de tela compuesto de tres franjas horizontales: azules la primera y la tercera, blanca la del centro.

Sus dimensiones oficiales son: 3.25 metros de largo por 1.89 de ancho; cada franja, 0.63 de ancho. Puede dársele cualquier dimensión, siempre y cuando conserve las mismas dimensiones y colores.

Las dos franjas azules simbolizan los dos océanos que bañan a Centroamérica: el Océano Pacifico y el Atlántico, el color blanco simboliza la paz.

Lleva en medio de la franja blanca el Escudo Nacional o las palabras "Dios Unión Libertad". El Escudo es llevado si la organización que coloca la Bandera es gubernamental (Casa Presidencial, embajadas, delegaciones del gobierno, etc.) y todo lo que concierne el ejercito (cuarteles, aviones, buques, etc.).

La Bandera llevara "Dios Unión Libertad" en letras doradas si es colocada por cualquier individuo u organización que no sea del gobierno; como las escuelas, edificios públicos, barcos mercantes, etc.